Управление ГБУ ДО ДЮТЦ "Васильевский остров" строится на принципах единоначалия и коллегиальности. Единоличным исполнительным органом ОУ является руководитель - директор (Устав п. 3.3) Коллегиальными органами управления являются: Общее собрание работников образовательного учреждения; Педагогический совет. Коллегиальные органы управления созданы и действуют в соответствии с Уставом ГБУ ДО ДЮТЦ "Васильевский остров" и Положениями об этих органах.